他效忠于皇帝，效忠于朝廷，效忠于大明，但是却不希望朝廷过多的干涉东江镇的事务。这倒不是说他有什么异心，而是他本身就是喜欢独断专行的性格。
所谓宁为鸡口不为牛后，便是指他这样的人了。不过话要说回来，如果他不是这样性格的话，也就创建不了现在的东江镇。
在一个没有无线电的时代，一个孤悬海外的边镇大帅，事事都要请示朝廷的话，那么战场上的战机早就消失了。
王化贞驾临皮岛，差不多就分走了他在东江镇的民政权力，和同朝鲜的交涉权力。而锦衣卫在皮岛建立的治安肃奸科，正在渗入到东江镇的各部队中。
然而毛文龙对此却毫无办法，崇祯登基后就派出了犒赏东江镇的船队，还公开宣布要把东江镇的烈属和伤残军士运回后方去赡养。
在毛文龙的号召下，一直为保卫大明作战的东江镇将士们，对此都兴高采烈，丝毫没有抵触朝廷派人对于东江镇事务的整理。
在这些东江镇的中下层军士眼中，这是朝廷并没有忘记他们的表现，朝廷认可了他们为大明付出的牺牲。
就算是东江镇的精神领袖毛文龙，这一刻也无法阻挡东江镇军士们，对于朝廷的效忠之心。
毛文龙对此虽然牢骚满腹，但还是在表面上接受了，朝廷对于东江镇的整顿，并同意回京面圣。
这使得他获得了安东侯的爵位，和一枚国士无双的勋章。毛文龙对于勋章倒是很感兴趣，但是却不太敢光明正大的戴在胸前。他觉得这个国士无双的称号实在有些让他脸红，毕竟他并没有收复辽东的大城，只是占了几个海岛而已。
毛文龙在崇祯的注视下，还是勉强的赞同了，皇帝提出的军官轮换制度的主张。从这一刻开始，他便明了，东江镇将不再是他一个人的东江镇了。