面是大多数船长在失败后都萌生了退意。荷兰东印度公司毕竟是一个商业公司，巴达维亚此次聚集起来的船只大部分都是武装商船，这些商船的主人是来东方寻求财富的，而不是来为公司作战的。
当公司的实力远远超过公司的敌人时，这些商船的船主自然会兴高采烈的跟随公司出战分一杯羹。但是像如今这样，对方具有不弱于公司的力量时，船主们要考虑，继续作战下去是否符合自己的利益了。
正是因为熟知这些船主的本性，普特曼斯才想要暂且撤退，选择一个更为有利的场所同明军交战。背靠南澳岛，起码荷兰人还有几分底气，在福州外海同明人交战，一旦战局出现不利，那些见风使舵的商船未必不会选择逃离战场，毕竟船只一旦受损，他们可游不回巴达维亚去。
只不过普特曼斯顺从了大部分船主的意思南撤，却大大的挫败了舰队主力战船的士气。这也使得荷兰舰队的纪律性迅速败坏了下来，当然原本荷兰商船的纪律性也不怎么样。
不过在瞬息万变的战场，失去了纪律性的舰队显然是要遭受惩罚的。因为荷兰人此前已经把厦门的船只消灭的差不多了，因此他们此次抵达金门岛时便失去了警惕性，认为厦门岛是派不出舰队来袭击他们的，原本在舰队外围放哨的船只也没有按照规定巡逻，使得郑军舰队出现在一公里外时，才有人发现并示警。
郑芝龙此时也采取了如同普特曼斯突袭厦门港的战术，他下令100余艘小型放火船直接冲入了荷兰舰队之放火，而自己则率领55艘大号福船在外围拦截。
在一片烟雾之，荷兰舰队彻底失去了指挥，所有船只自顾着自家启碇扯帆逃离，完全没有帮助同伴抵抗那些靠近的放火船的意思。
连普特曼斯自己，也在第一时间逃离了这场烟雾和火焰的海地域，而没有试图留下来挽救自己的舰队。虽然普特曼斯事后为自己辩解说：“…那些国士兵极为勇敢，他们对大炮、步枪与火焰都毫不畏惧…
他们全部舰队都装备成了火船，不是要来交锋作战的。相反的，是要来钩住我们的船放火燃烧的…在一瞬间火炎那么惊人地高耸的炎烈起来，实在令人难以置信…”
虽然普特曼斯面对公司的质询如此信誓旦旦，但是最终依然被公司囚禁了起来，直到他的家属为他支付了二万五千荷兰盾，他才被公司释放回国。
不过位于战场的普特曼斯此时还不知道自己的结局，冲出烟雾和火焰包围的他，又遇了围追堵截的明军战船，这使得普特曼斯连回头救