有其他海盗势力，以及此刻隐藏着日本海域的郑氏海盗集团残余势力也必须彻底清除，以免到时候养虎为患，使得这郑芝龙又卷土重来。
朱由校决定在自身军事势力进一步壮大之前暂时性停止海外扩展的步伐，在此期间，他必须把北方的建奴与蒙古林丹汗部彻底解决，还有战争意图越来越明显的罗刹国也必须给予沉重打击，最好是逼迫其停止东进到东北亚的扩张步伐，即便是要解决这些局部势力，朱由校现在都觉得自己大明的兵力还是有些捉襟见肘。
为此，必须进一步增加扩充军队，增加军费开支。
此时六部之中，兵部俨然已经成了最重要的部门，其经费开支几乎已经超过了户部，很多时候，为了方便直接进行军事开支，朱由校特旨暂时将盐铁以及皇家资本等所得税收由兵部直接与皇家银行交接，而省掉户部核算这一环节，以避免过多的中间程序，降低效率。
因为接下来不打算再在南洋起战端，而对爪哇国的已经占领区在以后的日子里只会进行殖民建设与原材料掠夺，所以朱由校便决定将战斗力强悍的禁卫军第四军调回国内云贵一带，继续进行招募扩充，而将孙承宗及其领导的曹文诏部调到爪哇国去搞建设，孙承宗作为一名老臣，善于搞军事建设，且近年来在陕西搞恢复民生也搞得很好，而曹文诏不仅仅是打战打得好，屯田也有卓越的表现，让他去对付爪哇国的土著残余势力倒也不是问题。
对于西方殖民者或者其他海洋势力是否会趁着大明帝国在忙于针对北方的战事时，而趁机谋夺大明对爪哇国的所有权，这一点倒也并不值得去担心，毕竟即便曹文诏等军队无法应付，还有南洋舰队可以制衡这些西方殖民者，而且朱由校还命黑娃的第一旅将驻扎点改在爪哇国，以随时警备西方殖民者可能有的挑衅。
孙承宗和曹文诏到达爪哇国后，如何对爪哇国进行殖民化，如何推广汉文化和建立大明行政体系以及教育体系，另外，皇家工业公司和皇家织造局等皇家资本何时去爪哇国扩张业务等都是后话。
而现在，作为大明帝国掌舵者的皇帝陛下朱由校则要开始着手准备对建奴的最后一击。
根据锦衣卫提供的最新情报，此时的建奴已然渐渐又有抬头之势，皇太极通过吞并好几位八旗旗主的方式进一步巩固了自己的皇权，而且这皇太极似乎也进一步搞清楚了目前态势，居然开始派人去与罗刹国联络，看这架势似乎不仅仅是要蒙古林丹汗部一起联合对抗大明，还要引来罗刹国这个大敌。
这就逼