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洪武十三年(1380)九月初三，朱亮祖父子被押到南京。一见朱元璋满脸怒气，朱亮祖立刻跪了下去，膝行向前，不住地以头撞地，请求宽恕。朱元璋未听其分辨，便命武士对其进行鞭打。武士们也知道，朱元璋这次要的是死的，都暗暗加重了力度，不一会儿，朱亮祖父子便血肉横飞，气绝身亡。这是朱元璋杀的第一个贪官，此后他一发不可收拾，纵观朱元璋这一切，小景认为，这都是源自他起自民间，目睹元末政治**、官贪吏残的情形，深恨贪官污吏蠢政害民，因而于建国之后，乃大力整顿吏治，不仅设立章程，禁止官吏玩忽职守，不务公而务私，并且制定严刑峻法，用以制裁贪官污吏，纠正贪墨之风。当时法令规定，凡是发现有贪赃害民的官吏，百姓可以直接擒拿送至京师。若是有敢阻挡者，即行灭家灭族。凡是监守自盗仓库钱粮等物者，若赃至六十两银子以上者，乃枭首示众，并处以剥皮之刑。当时府、州、县衙门左面皆特立一庙，用来祭祀土地神，即是剥皮的场所，称为皮场庙。又官府公座两旁，各悬挂一个塞满草的人皮袋，使坐堂官吏触目惊心。朱元璋称帝三十余年间，先后惩办了不少贪官污吏。如仅在洪武九年（1376年），将有罪官吏发往安微风阳屯田者，即至万余人。在其所处理的一系列贪污案件中，最为突出的是郭桓案。郭桓官至户部侍郎，征收浙西秋粮贪赃枉法，洪武十八年（1385年）事发，结果被追赃粮七百万石，六部左、右侍郎以下的官均被处死，供词牵连到各布政司的官吏，被杀者又有数万人，追赃还牵连到全国许多富户，以致中产之家大抵皆破产。像这样地使用严刑峻法惩治贪官污吏和如此大规模地诛杀贪官污吏，可以说从古以来所未有。朱元璋大张旗鼓地雷厉风行地重惩贪吏，这对于杀减贪风，改良吏治，的确起到了一定作用。
不过应当指出，朱元璋并不能彻底消除贪污现象。一面，朱元璋不断地诛杀贪官；一面，贪赃枉法行为又在时时发生，最后弄得朱元璋也十分苦恼，大为叹息不止。此外，还应指出，朱元璋对待贪官用法过严，酷刑肆杀，株连众多，甚至妄兴大狱，任意杀人，又是为了建立**君主的威权，表现了封建**主义的极端残酷。如有所谓空印案，便是朱元璋大逞**淫威的一例。当时每年各布政司及府州县都要派上计吏到户部，报告地方钱粮、军需等事，凡报册上钱粮之数，必须与部所定数字完全吻合，若有分、毫、升、合对不起来，整个报册便被驳